Existem estudiosos do assunto que apontam que esta é uma definição inadequada, pois se deve considerar a medicina como constituída por métodos cientificamente validados de diagnóstico e tratamento, independente do facto de ser aplicada no oriente ou ocidente. Ainda, o termo alopatia foi criado pelo inventor da homeopatia como uma oposição ao princípio de "cura pelo semelhante" da homeopatia. Assim, o que estiver validado, mesmo que não convencional no meio, como fitoterapia, faz parte do arsenal de diagnose e terapia.

Estes mesmos estudiosos indicam que uma definição mais adequada para a medicina alternativa seria o conjunto de práticas de diagnose e terapia sem a apropriada validação científica, ou que sejam consideradas inacessíveis ao método científico experimental, o que neste último caso pode ocorrer nas práticas de cura via métodos metafísicos e espirituais, diferentemente das práticas médicas convencionais.

Medicina e Ciência

A postura da Organização Mundial de Saúde face à utilização de tratamentos alternativos é a de orientar no sentido de ter cautela, devido ao facto de existirem muitos terapeutas impreparados seguindo teorias relacionadas a crenças, além de pessoas inescrupulosas que se valem da boa fé e falta de informação para ludibriar e obter benefícios próprios. Nos dias de hoje esta é uma recomendação válida na maioria das situações do quotidiano, e ocorre em todos os sectores profissionais e comerciais.

Reconhecimento científico

O princípio da hierarquia das evidências postulado por Sackett em 1989 estabelece as possíveis formas de verificar a validade de técnicas diagnósticas e terapêuticas:

1. Revisão sistemática de experimentos aleatoriamente controlados (RCT – Randomized Control Trial).
2. Experimentos controlados aleatoriamente.
3. Estudos não controlados.
4. Consenso médico baseado na experiência individual.
5. Impressões Clínicas.